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Nature:全新致癌機制,相分離渦輪異常染色質(zhì)成環(huán),促進(jìn)癌癥發(fā)展

2022-01-17 12:16 來(lái)源:安康婦科醫院

乳癌的蓬勃發(fā)展與特異功能性酵素內在無(wú)序區可定義(IDR)的基因氨基酸精神狀態(tài)密切系統功能性。各種酵素(最主要特異功能性系數、染色質(zhì)調節劑和RNA相結合蛋白)之前的IDR通過(guò)液-液比方說(shuō)(LLPS)轉變成凝聚器皿,阻礙從線(xiàn)粒體器轉變成和其會(huì )耐受到基因氨基酸特異功能性的無(wú)數生器皿體流程。

是非的液-液比方說(shuō)(LLPS)是特指融合兩個(gè)不系統功能性基因氨基酸突變的流程。該流程時(shí)有發(fā)生在線(xiàn)粒體核內,并能夠轉變成具各種器皿理特功能性的可定義,這些可定義可以增進(jìn)乳癌,例如急功能性肺炎的時(shí)有發(fā)生蓬勃發(fā)展。在急功能性肺炎之前,大分子蛋白(NUP98或NUP214)的反復線(xiàn)粒體反之亦然產(chǎn)生了一種精神狀態(tài)融合體,它好像延續大分子蛋白 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸殘基(FG)的串聯(lián)分散多次重復氨基酸。然而,IDR如何導致基因氨基酸正確調控和時(shí)有發(fā)生唯不明了。

2021年6月23日,以東卡羅萊納大學(xué)教堂山分校 Gang Greg Wang 設計團隊等 Nature 刊出了月出版:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的學(xué)術(shù)研究博士論文。

該學(xué)術(shù)研究證明了比方說(shuō)是乳癌轉變成的特別設計因素所,乳癌通過(guò)比方說(shuō)獲得突變以創(chuàng )建致癌功能性特異功能性系數凝聚器皿,這同時(shí)強化了它們的基因氨基酸組特異功能性功能性并在裂解流程之前其會(huì )精神狀態(tài)圖像染色質(zhì)結構的轉變成。該學(xué)術(shù)研究是最早將比方說(shuō)與乳癌轉變成直接聯(lián)系起來(lái)的學(xué)術(shù)研究之一。因為在其他惡功能性之前辨別到了相近的基因氨基酸融合,社論之前概述的選擇性也可以解釋其他類(lèi)型的乳癌。

NUP98–HOXA9包含兩個(gè)酵素基序和一個(gè)相結合氨基酸。為了學(xué)術(shù)研究NUP98-IDR在肺炎時(shí)有發(fā)生之前的功用,學(xué)術(shù)研究設計團隊主要使用敲擊除了相結合氨基酸的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他們注意到,N-IDRWT/A9對1,6-己二醇(一種用于破壞相-比方說(shuō)凝聚體的化學(xué)器皿質(zhì))處理脆弱。純化的NUP98-IDR(N-IDR)蛋白在胃轉變成液體凝聚器皿。

為了必要功能性分析FG多次重復氨基酸對凝聚器皿轉變成的酸度發(fā)揮功用和多價(jià)功能性的重要功能性,學(xué)術(shù)研究設計團隊制備了帶有不同為數FG多次重復氨基酸的整合N-IDR酵素。他們注意到N-IDR包含38個(gè)或36個(gè)FG以酸度發(fā)揮功用的方式多次重復轉變成的冷凝,那些包含27個(gè)或11個(gè)FG的卻不能完成比方說(shuō)。暗示NUP98–HOXA9之前的IDR以?xún)r(jià)依賴(lài)和酸度依賴(lài)的方式創(chuàng )建LLPS。

NUP98–HOXA9通過(guò)同源結構可定義與DNA相結合,導致肺炎時(shí)有發(fā)生流程之前的基因氨基酸失調。接下來(lái),學(xué)術(shù)研究設計團隊通過(guò)染色質(zhì)免疫沉淀和生物信息學(xué)測序來(lái)分析IDR介導的比方說(shuō)對NUP98–HOXA9染色質(zhì)特異功能性功能性的阻礙。

結果顯示, N-IDRWT/A9具顯著(zhù)強化的基因氨基酸組占有率,而與無(wú)指導聚類(lèi)定義的巖值亞類(lèi)無(wú)關(guān)。此外,寬而密集的超強強化子樣巖是N-IDRWT/A9所都有的,并且在發(fā)育期和肺炎系統功能性基因氨基酸富集。

為了必要功能性分析IDR其會(huì )的LLPS在斯氏染色質(zhì)特異功能性之前的功用,他們透過(guò)了遺傳學(xué)和藥理學(xué)的方法,證明了IDR介導的LLPS在強化嵌合特異功能性系數特異功能性功能性方面的因果功用,密切系統功能性超強強化子樣巖處看到的那些。暗示IDR強化融合體的基因氨基酸組相結合并且強化靶基因氨基酸啟動(dòng)時(shí)。

為了測試NUP98–HOXA9通過(guò)LLPS轉變成染色質(zhì)循環(huán)系統的能夠,學(xué)術(shù)研究設計團隊生成了表達N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9線(xiàn)粒體的Hi-C圖譜,揭示了DNA循環(huán)系統和復制間的離地系統功能性功能性。

為了具體N-IDRWT/A9對Hi-C交談kHz的阻礙,他們群聚了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9表達線(xiàn)粒體之前500個(gè)最極端的N-IDRWT/A9守住位點(diǎn)間的相互功用除此以外。結果顯示,N-IDRWT/A9循環(huán)系統以基本上與CTCF無(wú)關(guān)的方式轉變成,與比方說(shuō)特別設計選擇性明確。另外,N-IDRWT/A9特異功能性循環(huán)系統再度連結強化子和靶基因氨基酸間的連結,支持了融合特異功能性系數的IDR通過(guò)比方說(shuō)在超強強化子樣靶點(diǎn)和癌基因氨基酸間其會(huì )DNA循環(huán)系統的觀(guān)點(diǎn)。

綜上所述,該學(xué)術(shù)研究注意到NUP98–HOXA9之前帶有的LLPS活功能性IDR對肺炎的時(shí)有發(fā)生和致癌功能性基因氨基酸表達程序的啟動(dòng)時(shí)至關(guān)重要。這些不穩定性由IDR的能夠介導:1)強化特異功能性系數與基因氨基酸組靶點(diǎn)的相結合;2)增進(jìn)強化子和癌基因氨基酸啟動(dòng)子間的長(cháng)距離循環(huán)系統。

該學(xué)術(shù)研究提供了一個(gè)致癌功能性突變的基本原理功能性證據,該突變在裂解流程之前增進(jìn)LLPS特別設計的特異功能性系數相結合和3D染色質(zhì)整合。由于含IDR的LLPS活功能性分子與廣泛的乳癌有關(guān),該學(xué)術(shù)研究概述的選擇性也可以解釋其他類(lèi)型的乳癌。

原始說(shuō)是:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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